AOP-XML: ein Austauschformat für toxikologische Wirkketten
Wissen über Wirkketten – wie ein molekularer Erstkontakt über Zwischenschritte zu einem schädlichen Effekt führt – lag in mehreren Datenbanken, die einander nicht lesen konnten. Wir haben das Format entworfen, das sie verbindet.
- Entwurf der Dokumentarchitektur auf Basis des OECD-Templates 201, abgestimmt mit der zuständigen Sachverständigengruppe und dem Entwicklungsteam der Wissensbasis
- Implementierung als XML-Schema-Definition, versioniert und übergabefähig an ein Repository der Auftraggeber
- Java-Referenzanwendung, die aus Fachdaten gültige Dokumente erzeugt, mit offenem Quellcode
- Validator in drei Ausprägungen – Konsolenanwendung, Desktop-Werkzeug und Web-Service –, damit Datenlieferanten vor der Einreichung selbst prüfen können
- Exportanwendung in C#/.NET Core, die Wirkketten- und Chemikaliendaten aus der bestehenden Wiki-Plattform in das neue Format überführt, lauffähig unter Windows und Linux und in die Web-Anwendung integrierbar
- Vorstellung des Formats und Klärung der Rückfragen auf einer Arbeitssitzung in den Räumen der US-Umweltbehörde EPA in Durham, North Carolina, mit anschließender Einarbeitung der Änderungswünsche
Warum es typisch für uns ist: Die eigentliche Arbeit lag nicht im Schreiben eines Schemas, sondern darin, zwischen mehreren Teams mit unterschiedlichen Datenmodellen eine Fassung zu verhandeln, mit der alle arbeiten können – und sie so zu dokumentieren, dass sie ohne uns weiterlebt.